转录组测序数据分析-百度云网盘资源分享
资源目录：
转录组测序数据分析
准备
| ├──02 1.转录组数据分析与挖掘原理.mp4 263.38M
| ├──03 2.准备参考基因组序列.mp4 125.71M
| ├──04 3.将gff转换为gtf.mp4 27.35M
| ├──05 4.提取最长转录本.mp4 91.27M
| ├──06 5.seqtk seqkit gffread gtftk的用法.mp4 58.67M
| ├──07 6.记录日志，后台执行.mp4 52.47M
| ├──08 7.使用Kingfisher下载公共测序数据.mp4 116.48M
| ├──09 8.任务监控（htop）和终止（kill）.mp4 50.05M
| ├──10 9.多任务的串并行.mp4 18.58M
| ├──11 10.批量生成脚本.mp4 44.72M
| └──《有参转录组》课程资料.txt 0.25kb
基础分析（先去学 Linux）
| ├──01 11.测序数据过滤和质控.mp4 92.87M
| ├──02 12.比对到参考基因组.mp4 113.73M
| ├──03 13.表达定量.mp4 96.42M
| ├──04 14.sam和bam文件格式.mp4 27.53M
| └──05 15.使用IGV对比对结果可视化.mp4 41.29M
高级分析（先去学 R 语言）
| ├──01 16.差异表达分析.mp4 109.78M
| ├──02 17.样本关系探索：聚类和PCA.mp4 263.37M
| ├──03 18.差异基因数量统计.mp4 146.93M
| ├──04 19.差异基因可视化：韦恩图.mp4 51.13M
| ├──05 20.差异基因可视化：火山图.mp4 35.22M
| ├──06 21.差异基因可视化：热图.mp4 37.71M
| ├──07 23.富集分析和OrgDB介绍.mp4 79.56M
| ├──08 24.从AnnotationHub构建OrgDB.mp4 47.50M
| ├──09 25.功能注释并构建OrgDB.mp4 95.43M
| ├──10 26.GO的常规富集分析.mp4 103.16M
| ├──11 27.GO的GSEA富集分析.mp4 70.12M
| ├──12 28.KEGG Pathway的富集分析.mp4 127.79M
| └──13 29.课程总结.mp4 46.19M
无参转录组+WGCNA 分析/
├──02 1.1 课程介绍.mp4 6.78M
├──03 1.2 使用 Bioconda 安装 Trinity.mp4 7.10M
├──04 1.3 安装 Trinity.mp4 21.87M
├──05 2.1 原始数据质控及批量生成脚本的技巧.mp4 35.49M
├──06 2.2 数据过滤及使用 awk 提取文件某一列.mp4 43.34M
├──07 3.1 使用 Trinity 进行转录本拼接.mp4 23.99M
├──08 3.2 使用 htop 监控和管理任务.mp4 23.77M
├──09 3.3 拼接结果统计.mp4 14.12M
├──10 3.4 使用BUSCO评价转录本拼接的质量(一).mp4 14.99M
├──11 3.5 使用BUSCO评价转录本拼接的质量(二).mp4 7.39M
├──12 4.1 表达定量.mp4 33.29M
├──13 4.2 shell 脚本中变量的定义和使用.mp4 11.22M
├──14 4.3 shell 中多行注释技巧.mp4 10.41M
├──15 4.4 解读表达定量程序源代码.mp4 42.84M
├──16 4.5 拼接出太多转录本怎么办？.mp4 9.16M
├──17 5.1 功能注释介绍.mp4 11.87M
├──18 5.2 Trinotate 软件安装和数据库部署.mp4 21.21M
├──19 5.3 使用 Transdecoder 鉴定 ORF.mp4 27.30M
├──20 5.4 blast 和 hmmer.mp4 11.49M
├──21 5.5 整合注释结果.mp4 33.53M
├──22 5.6 一键完成功能注释.mp4 47.92M
├──23 6.1 相关系数、聚类分析、heatmap.mp4 14.95M
├──24 6.2 使用 PtR 程序绘图.mp4 49.18M
├──25 7.1 使用 biocLite 安装 DESeq2.mp4 10.48M
├──26 7.2 差异表达分析.mp4 30.56M
├──27 7.3 提取差异基因列表.mp4 15.42M
├──28 8.1 富集分析介绍.mp4 4.58M
├──29 8.2 GO 富集分析.mp4 32.00M
├──31 31.WGCNA分析.mp4 195.82M
├──32 32.使用Cytoscape可视化.mp4 65.80M
├──33 30.WGCNA分析原理.mp4 17.26M
├──《WGCNA》课程资料.txt 0.25kb
└──《无参转录组》课程资料.txt 0.10kb
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